在加州海滩出生的小海龟萨米，跟其他海龟仔一样，须要深入海洋，踏上成长旅程，期间他遇上了刚刚孵化的美女海龟莎莉，一见钟情。谁料，一次突发事件，两只小海龟无端失散。萨米一方面要坚负海龟仔的成长使命，穿越海洋之旅，重回出生之地，同时它必须寻回他的至爱莎莉。萨米不畏艰辛，在老友雷的陪同下，克服重重难关，经历紧张刺激的冒险旅程。期间，萨米发现人类竟然不停破坏地球的自然环境。森美感到失望之际，却在危难间得到人类的拯救。时间一天一天过去，萨米必须击退食人鱼、力敌疯狂非洲海雕，寻找传说中的水底秘密通道。终于，萨米找到了莎莉，而莎莉亦没有忘记萨米。