隅田川に転落死した坂本祐介（佐藤幾優）の遺体が発見され、強行犯係の樋口顕（内藤剛志）は現場に向かう。藤本由美（片山萌美）によると、数日前、坂本が経営する食品輸入会社へ、肉に粘土状の欠片が挟まっていたというクレームがフレンチレストランから入っていた。同じ頃、大学付近で車の爆破事件が発生。樋口の娘・照美（逢沢りな）も巻き込まれ軽傷を負う。国際テロとみた公安部の梅田正之（嶋田久作）と柳瀬泰彦（宇梶剛士）は刑事部と合同捜査を主張。天童管理官（榎木孝明）は受け入れるが捜査員の間には微妙な空気が…。そんな折、樋口は生活安全部の氏家譲（佐野史郎）から元同僚の因幡芳治（尾美としのり）が会いたがっていることを聞く。国際テロ組織に入った噂もある因幡が何の目的で？やがて爆破で軍用爆薬が使用されたことが判明。テロ組織も事件の関与を発表し、国際テロの可能性が高まる中、樋口は坂本の死と爆破事件を繋ぐある証拠をつかむ。