生活在伦敦的帕丁顿（本·威士肖 配音）从退休熊之家修女院长（奥利维娅·科尔曼 饰演）的信件中得知，住在这里的露西婶婶非常思念他。于是帕丁顿与布朗一家决定动身秘鲁，一起回乡探望他心爱的露西婶婶。然而，露西婶婶的神秘失踪将帕丁顿与布朗一家带入意想不到的惊险旅程，他们将和船长（安东尼奥·班德拉斯 饰演）与船长女儿（卡拉·杜斯 饰演）共同闯入亚马逊的迷雾丛林和陡峭的秘鲁山巅，开启寻找“黄金国”的冒险。